尽管对乳腺癌的研究已取得了长足的进步，但临床上仍然存在着局部复发和远处转移、治疗方法的安全及有效性、生存质量不理想、早期癌检出率不高、发病原因和机理仍不十分清楚等诸多问题。这些都是困扰着临床疗效不能令人满意的难点，也是对研究者的挑战。
难点之一：乳腺癌复发和转移的预防与阻断
      乳腺癌复发和转移直接影响远期治疗效果。近年的研究表明，乳腺癌在早期即可发生微小转移。临床实践也证明，即使早期癌，外科治疗后也不能获得100%的长期生存率，而在局部肿瘤控制许多年后，仍可有血行转移。大约80%的乳腺癌患者，在20年内终因转移性病变而死亡，胡有效地预防和阻断乳腺癌复发和转移是提高生存率的关键和难点之一。
     化疗、内分泌治疗和中医药治疗等全身治疗可提高对微小转移病变的控制，对预防和阻断乳腺癌复发和转移有积极的作用。近年临床上应用新辅助化疗对可手术切除的乳腺癌患者尽早地控制体内已存在的微小转移病变，减少术后复发和播散，提高生存率均取得了较好的效果。
     近年来比较重视血管生成和微血管密度对乳腺癌预后的影响，指出微血管定量与乳腺癌浸润周围血管有关。微血管生成除肿瘤源性因素外，还与肿瘤相关的炎性细胞等因素有关。抑制微血管生成可作为防治乳腺癌复发和转移的有效措施，如应用血管生长抑制剂（半合成的烟曲霉素衍生物（TNP-470）、血管内皮生长因子抗体、人参等）配合其它疗法将可改善乳腺癌的预后。
     中医对肿瘤治疗法则的临床和实验研究多侧重在扶正固本和活血化瘀两面方面，前者通过激活非特异性巨噬细胞和自然杀伤细胞，加速T淋巴细胞分裂生干扰素及调整机体免疫功能及Ts和TH的比例，提高肿瘤患者的免疫功能。后者通过降低血小板的粘附聚集性能，增加血流量，改善机体高凝状态，使肿瘤处于抗癌及机体免疫功能抑制状态下，从而提高疗效。二者通过改善机体免疫功能和血液高凝状态的作用，对防止肿瘤复发和转移意义较大。常用的药物有：黄芪、人参、冬虫夏草、常参、刺五加、枸杞子、淫羊蓉、何首乌、灵芝、白术、猪苓、茯苓、川芎、大黄以及四君子汤、十全大补汤、四物汤等。
难点之二：如何进行乳腺癌的个体化治疗
      乳腺癌的个体化治疗，是根据病人的个体身体状况（如体质、年龄，又经，妊娠或哺育，伴随疾病或各脏腑和系统功能，尤其是免疫和骨髓功能状况等）和疾病情况（如病理类型，病期，中医证候类型和发展趋势等），有计划、合理、有效地应用现有的各种治疗和/或康复手段及研究成果进行有针对性的治疗，并且注意在治疗过程中根据患者对各种治疗的反应进行合理调整，尽可能对患者施行“量体裁衣”式的治疗。使治疗更安全、有效，以期较大幅度地提高治愈率，改善病人的生活质量。运用科学的方法和现代科学技术手段探讨中医药治疗乳腺癌的机理，寻找中西医结合的切入点，使中西医两个不同的医疗体系有机地结合，融会贯通，优势互补。实践证明，中西医结合的个体化综合疗法在提高乳腺癌的治愈率和生存率，延长生存期，改善生存质量等方面优于单纯的中医治疗或西医治疗。因此，中西医结合个体化综合治疗是提高乳腺癌临床疗效的方向。
      由于目前乳腺癌的发病机制尚不明确及患者的个体差异性等因素，乳腺癌的中西医结合综合治疗很不规范。根据目前的研究报道和我们的临床体会，分别对临床常用的乳腺癌及其转移的中西医结合综合治疗方案和中西医结合治疗乳腺癌的策略进行了总结，分别详见本篇[治疗]和[经验与体会]部分。
难点之三：如何改善乳腺癌患者的生存质量
      近年国外医学界对生存质量（QOF）的研究日趋重视。我国肿瘤防治规划纲要（1986~2000）提出“近期的目标是提高肿瘤患者的生存率，改善生存质量……”。随着人民生活水平的提高和审美观的要求，乳腺癌患者及家属对QOF的期望值也相应提高。如何在提高乳腺癌尤其是中晚期癌的局部缓解率的同时，改善其QOF，保持其女性特征美，是近年来乳腺癌治疗中的难点之一。
      改善乳腺癌患者的QOF应包括以下内容：①提高早期癌的治愈率；②在保证清除乳腺癌肿瘤灶的情况下尽可能缩小手术范围；③合理、有效地安排治疗方案，改善中期或局部晚期患者的身体状况，提高手术切除率，避免或减少医源性并发症的发生；④重视并发症的预防和治疗；⑤控制乳腺癌复发和转移，提高无病生存率和远期疗效；⑥乳房重建与整形；⑦控制晚期乳腺癌症状，尤其应该指出的是，在实施姑息治疗时，应以追求良好的QOF为其最高准则；⑧重视患者的心理、生活护理，树立战胜癌症的信心，保持健康的心理和精神状态。
      中医学认为人体是一个以五脏为中心，通过经络气血联系内外上下的有机整体，有阴阳五行学说、天人相应、形神统一等整体观的思想指导下，历来重视自然、社会、生理和心理诸因素对人类疾病的综合作用。在治疗上最突出的特点是以辨证论治为指导原则，并认为“证”是一种以临床机能变化（“病”）为主的整体定型反应形式，“证”与“病”的关系是“证”从属于“病”，相应的治疗也是调整患者的机体状况，调动内在抗病能力。临床实践表明，手术、放诒及化疗在消灭癌性病灶和癌细胞方面是常用的有效手段和方法，但同时会给机体带来损伤，临床上常可引起不同程度的毒副反应或并发症，影响QOF和治疗的顺利进行。而中医中药在减少放、化疗毒副反应，防治并发症和反遗证，提高手术切除率及放、化疗完成率，增强机体自身抗癌免疫功能，改善QOF等方面有独特的疗效，二者配合运用可提高临床疗效（见前相应部分）。目前，以手术为主的中西医结合综合治疗是我国治疗乳腺癌的基本模式，受到世界医学界的关注。由此可见，中医中药在改善乳腺癌患者QOF具有重要的意义。
难点之四：乳腺癌癌前病变的干预治疗
      大量研究表明，癌前病变属可逆性病变，经过治疗可以阻断和逆转其发展。我们应用自行研制的中药制剂消癖口服液1~6号对61例乳腺癌癌前病变进行干预治疗，显效28例（45.9%），有效28例（45.9%）。结果显示中医药对乳腺癌癌前病变的干预治疗取得了较好的效果。